db.collection.find({ }).forEach(function(d) { 
  db.getSiblingDB(目標DB)[目標Collection].insert(d); 
});

-- 範例 --
db.clicks.find({
  click_date: {
    $gte: 20180701,
    $lt: 20180708
  }
}).forEach(function(d) { 
  db.getSiblingDB('newDB')['clicks'].insert(d); 
});

此項指令很耗操作時間,
建議透過mongo shell來操作